明朝末年，权宦魏忠贤独裁专权，皇上筹谋铲除魏忠贤。此时，原本要入宫为妃的洪御史之女莫名死亡，六扇门都指挥使向石派出叶飞和云灵与魏忠贤斗智斗勇，查清案件真相。魏忠贤设下更大陷阱，六扇门惨遭屠戮。叶飞和云灵奋起反击，与皇上联手，终将魏忠贤铲除。最终，云灵入宫为妃，叶飞接掌六扇门。
